全球首个 · 多倍体桑单倍型解析基因组

长果桑基因组Morus × TWCG

来自台湾长果桑(Taiwan Changguosang, TWCG)AAB 异源三倍体栽培桑,
一份 无缺口(gap-free)、单倍型解析的 1.05 Gb 基因组,
揭示了它对坏死营养型真菌 Ciboria shiraiana完全免疫之谜。

🧬 1.05 Gb 🧩 42 条染色体 ✨ Gap-free 🛡️ 完全抗病 🤝 AlphaFold3 互作
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01 / About

关于长果桑 TWCG

一种无籽三倍体果桑,也是抗病育种的明星材料。

🌿

身世:AAB 三倍体

TWCG 由长果桑(Morus laevigata白桑(M. alba种间杂交而来的无籽三倍体。其三个单倍型中,HapA1、HapA2 来自长果桑HapB 来自白桑

🛡️

超能力:完全免疫

对坏死营养型真菌 Ciboria shiraiana(引起肥大性桑椹菌核病 HSS)表现完全免疫。阐明其免疫机制,可为抗坏死营养型真菌的作物分子育种提供新策略。

🍇

价值:药食同源

桑果富含花青素、芦丁、白藜芦醇与多糖,被誉为"21 世纪最佳保健水果"。目前我国果用桑仅占桑园 5%–9%,病害是扩张的主要障碍。

02 / Genome at a Glance

基因组概览

一份高连续、高完整、无缺口的单倍型解析基因组。

0
基因组总大小
1,048,561,684 bp
0
伪染色体数
每单倍型 14 条
0
预测蛋白编码基因
平均 CDS ≈ 1.2 kb
0
组装缺口 (Gap-free)
T2T 水平染色体 16 条
0
BUSCO 组装完整度
95.3% 为重复拷贝
0
Merqury 质量值 QV
完整度 99.61%
0
Contig N50
Scaffold N50 22.60 Mb
0
注释非编码 RNA
ncRNA 总数
03 / Authors & Affiliations

作者与完成单位

本基因组由西南大学资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室等团队完成。

👥 作者(共同第一 #)

Wei Fan#, Yuane Chen#, Mengxia Xu#, Zhongqiang Xia, Chengli Zhou, Caiquan Tao, Zhennan Li, Duanyang Liu, Xiaohui Gu, Xiling Wang, Zhiguang Song, Zhengang Li, Aichun Zhao*

* 通讯作者:zhaoaichun@hotmail.com · zhaoaichun@swu.edu.cn

🏛️ 完成单位

  • 西南大学 资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室(重庆)
  • 中国农业科学院 深圳农业基因组研究所
  • 云南省农业科学院 蚕桑蜜蜂研究所(蒙自)
  • 重庆市蚕业科学技术研究院