全球首个 · 多倍体桑单倍型解析基因组
长果桑基因组Morus × TWCG
来自台湾长果桑(Taiwan Changguosang, TWCG)的
AAB 异源三倍体栽培桑,
一份 无缺口(gap-free)、单倍型解析的 1.05 Gb 基因组,
揭示了它对坏死营养型真菌 Ciboria shiraiana 的完全免疫之谜。
01 / About
关于长果桑 TWCG
一种无籽三倍体果桑,也是抗病育种的明星材料。
🌿
身世:AAB 三倍体
TWCG 由长果桑(Morus laevigata)与白桑(M. alba)种间杂交而来的无籽三倍体。其三个单倍型中,HapA1、HapA2 来自长果桑,HapB 来自白桑。
🛡️
超能力:完全免疫
对坏死营养型真菌 Ciboria shiraiana(引起肥大性桑椹菌核病 HSS)表现完全免疫。阐明其免疫机制,可为抗坏死营养型真菌的作物分子育种提供新策略。
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价值:药食同源
桑果富含花青素、芦丁、白藜芦醇与多糖,被誉为"21 世纪最佳保健水果"。目前我国果用桑仅占桑园 5%–9%,病害是扩张的主要障碍。
02 / Genome at a Glance
基因组概览
一份高连续、高完整、无缺口的单倍型解析基因组。
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基因组总大小
1,048,561,684 bp
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伪染色体数
每单倍型 14 条
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预测蛋白编码基因
平均 CDS ≈ 1.2 kb
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组装缺口 (Gap-free)
T2T 水平染色体 16 条
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BUSCO 组装完整度
95.3% 为重复拷贝
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Merqury 质量值 QV
完整度 99.61%
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Contig N50
Scaffold N50 22.60 Mb
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注释非编码 RNA
ncRNA 总数
03 / Authors & Affiliations
作者与完成单位
本基因组由西南大学资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室等团队完成。
👥 作者(共同第一 #)
* 通讯作者:zhaoaichun@hotmail.com · zhaoaichun@swu.edu.cn
🏛️ 完成单位
- 西南大学 资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室(重庆)
- 中国农业科学院 深圳农业基因组研究所
- 云南省农业科学院 蚕桑蜜蜂研究所(蒙自)
- 重庆市蚕业科学技术研究院